Hi,
du darfst da nicht Äpfel mit Birnen verwechseln...
Wenn das Template per se lahmt, nützt es erstmal wenig auf einen anderen Webserver umzusteigen, zumal nginx und Magento tiefere Kenntnisse erfordern um wirklich die Vorteile zu nutzen. Die Vorzeichen sprechen eher die Sprache, 69$ Template, schlechte Codequalität. Aber ohne konkrete URL kann man dazu keine umfassende Einschätzung treffen.
Der Profiler ist dafür da, die Ausführung auf Serverebene zu messen, sprich grob das parsen von php Dateien (ist was komplexer). Wenn nicht grober Unfug im Template gemacht wurde, wirst du hier also nicht unbedingt den Fehler finden. Es hat sich ja auch im Kern nix verändert. Die Bilder kannst du so vergessen, das muss man sich live angucken und mal mehrfach aktualsieren, vorallem auch im Kontext betrachten (also wo auf der Seite bin ich)
Der Hinweis "Move scripts to the bottom of pages to ensure other resources don't block." bezieht sich auf JS-Ressourcen, also Ressourcen die das clientseitige Rendering blockieren.
Ich denke mit deinen eher rudimentären Kenntnissen, ist das ganze ein Risikospiel. Wenn du dir das leisten kannst, nur zu - aus Fehlern lernt man ja (wir auch 
). Ansonsten kann ich dir anbieten, dass wir das System kostenfrei erstmal oberflächlich analysieren (vorher können wir kein seriöses Angebot machen) wenn du uns danach beauftragst. Beachte aber, das wenn der o.g. Fall zutrifft, hier schnell 2-3 Manntage(oder mehr, kommt drauf an wo du hin willst) auf einen zukommen.
Guck dir mal unsere Referenz haustierkost.de an, dort ist Varnish, nginx und einiges anderes im Einsatz. Wir rendern das html in 200-300ms.
Unsere eigene Seite:
http://tools.pingdom.com/fpt/#!/dGCGIw/https://www.gewaechshaus.eu