Te recomiendo que hagas un analisis de que carpeta es la que está creciendo. Quizá no tienes alguna politica de manejo de logs y quizá es var/log el que crece por alguna excepci'on muy grande que ocurre en cada request o inclusive me ha pasado en elrrores al mostrar productos y estarias mandando una excepci'on grande por cada producto mostrado. Esto genera que los archivos de logs crescan demasiado y se ocupe el disco en poco tiempo.
Recomendación: Revisa que folder dentro del MAGENTO_ROOT es el que crece de esta forma. Por lo generar el contenido crece en: var, pub y generated. Valida si es alguno de esos y cual subfolder de estos crece más.
De allí podrías tener una idea de que está ocacionando este aumento en el consumo de espacio en disco.
Saludos,
